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JAHIS標準11-002
一方、医用画像の標準規格であるDICOM（Digital Imaging and Communications in Medicine）においては、臓器画像と顕微鏡画像、WSI（Whole Slide Images）に関する規格が制定された。
しかしながら、病理・臨床細胞部門では対応実績を持つ製品が未だない実状に鑑み、この規格の普及を促進すべく、病理・臨床細胞部門で多く扱われている臓器画像と顕微鏡画像から規約を作成することにした。
本規約をまとめるにあたり、ご協力いただいた関係団体や諸先生方に深く感謝する。本規約が医療資源の有効利用、保健医療福祉サービスの連携・向上を目指す医療情報標準化と相互運用性の向上に多少とも貢献できれば幸いである。
２０１２年２月
一般社団法人 保健医療福祉情報システム工業会
検査システム委員会
病理・臨床細胞部門システム専門委員会
JAHIS病理・臨床細胞DICOM画像データ規約Ver.1.0
ま え が き
院内における病理・臨床細胞部門情報システム（APIS: Anatomic Pathology Information System）の導入及び運用を加速するため、一般社団法人保健医療福祉情報システム工業会（JAHIS）では、病院情報システム（HIS）と病理・臨床細胞部門情報システム（APIS）とのデータ交換の仕組みを検討しデータ交換規約（HL7 Ver2.5 準拠の「病理・臨床細胞データ交換規約 Ver.1.0」）を作成した。一方、医用画像の標準規格であるDICOM（Digital Imaging and Communications in Medicine）においては、臓器画像と顕微鏡画像、WSI（Whole Slide Images）に関する規格が制定された。
しかしながら、病理・臨床細胞部門では対応実績を持つ製品が未だない実状に鑑み、この規格の普及を促進すべく、病理・臨床細胞部門で多く扱われている臓器画像と顕微鏡画像から規約を作成することにした。
本規約をまとめるにあたり、ご協力いただいた関係団体や諸先生方に深く感謝する。本規約が医療資源の有効利用、保健医療福祉サービスの連携・向上を目指す医療情報標準化と相互運用性の向上に多少とも貢献できれば幸いである。
２０１２年２月
一般社団法人 保健医療福祉情報システム工業会
検査システム委員会
病理・臨床細胞部門システム専門委員会
目 次
１．はじめに
２．適用範囲
３．引用規格・引用文献
４．用語定義
４．１． 主要用語
４．２． 値表現（VR）
４．２．１． AE 応用エンティティ （Application Entily）
４．２．２． AS 年齢別 （Age String）
４．２．３． AT 属性タグ （Attribute Tag）
４．２．４． CS コード列 （Code String）
４．２．５． DA 日付 （Date）
４．２．６． DS 10進数列 （Decimal String）
４．２．７． DT 日時 （Date Time）
４．２．８． FL 単精度浮動小数点 （Floating Point Single）
４．２．９． FD 倍精度浮動小数点 （Floating Point Double）
４．２．１０． ＩＳ 整数列 （Integer String）
４．２．１１． LO 長列 （Long String）
４．２．１２． LT 長テキスト （Long Text）
４．２．１３． OB その他のバイト列 （Other Byte String）
４．２．１４． ＯＦ その他の浮動列 （Other Float String）
４．２．１５． OW その他のワード列 （Other Word String）
４．２．１６． PN 人名 （Person Name）
４．２．１７． SH 短列 （Short String）
４．２．１８． ＳＬ 符号付長整数 （Signed Long）
４．２．１９． SQ 項目のシーケンス （Sequence of Items）
４．２．２０． ＳＳ 符号付き短整数 （Signed Short）
４．２．２１． ＳＴ 短テキスト （Short Text）
４．２．２２． TM 時間 （Time）
４．２．２３． UI 固有識別子（UI） （Unique Identifier）
４．２．２４． ＵＬ 符号なし長整数 （Unsigned Long）
４．２．２５． UN 未知 （Unknown）
４．２．２６． ＵＳ 符号なし短整数 （Unsigned Short）
４．２．２７． ＵＴ 無制限テキスト （Unlimited Text）
４．２．２８． 注意
４．３． データ要素タイプ
４．３．１． タイプ１ 必須データ要素
４．３．２． タイプ１Ｃ 条件付きデータ要素
４．３．３ タイプ２ 必須データ要素
４．３．４． タイプ２Ｃ 条件付きデータ要素
４．３．５． タイプ３ 任意選択データ要素
４．３．６． シーケンス内のデータ要素タイプ
４．４． シーケンス
４．５． 属性マクロ
５．説明的な情報
５．１． 標本の識別・管理
６．DICOM画像データ構造
６．１． 画像データ構造
６．２． DICOMファイルメタ情報
６．３． ＶＬ（可視光）顕微鏡画像情報オブジェクト定義
６．４． ＶＬ（可視光）スライド座標顕微鏡画像情報オブジェクト定義
６．５． ＶＬ（可視光）写真画像情報オブジェクト定義
７．情報オブジェクト定義（ＩＯＤ）モジュール
７．１． 患者モジュール （Patient Module）
７．２． 一般検査モジュール （General Study Module）
７．３． 一般シリーズモジュール （General Series Module）
７．４． 基準座標系モジュール （Frame Of Reference Module）
７．５． 一般的装置モジュール （General Equipment Module）
７．６． 一般画像モジュール （General Image Module）
７．７． 画像画素モジュール （Image Pixel Module）
７．８． 収集コンテキストモジュール （Acquisition Context Module）
７．９． 標本モジュール （Specimen Module）
７．１０．ＶＬ（可視光）画像モジュール （ＶＬ Image Module）
７．１１．スライド座標モジュール （Slide Coordinates Module）
７．１２．SOP共通モジュール （SOP Common Module）
８．属性マクロ
８．１． コードシーケンスマクロ （Code Sequence Macro）
８．２． 人識別マクロ （Person Identification Macro）
８．３． 内容項目マクロ （Content Item Macro）
８．４． 画像SOPインスタンス参照マクロ （Image SOP Instance Reference Macro）
８．５． 一般病理マクロ （General Anatomy Macros）
８．５．１． 一般病理必須マクロ （General Anatomy Mandatory Macro）
８．５．２． 一般病理要求マクロ （General Anatomy Required Macro）
８．５．３． 一般病理任意マクロ （General Anatomy Optional Macro）
８．５．４． 主要病理構造マクロ （Primary Anatomy Structure Macro）
８．６． 依頼属性マクロ （Request Attributes Macro）
８．７． SOPインスタンス参照マクロ （SOP Instance Reference Macro）
８．８． 実行検査構成要素概要マクロ （Performed Procedure Step Summary Macro）
８．９． HL7v2階層指定子マクロ （HL7ｖ2 Hierarchic Designator Macro）
８．１０．患者ID発行者マクロ （Issuer of Patient ID Macro）
９．マッピング・リソース
９．１． 略語等説明
９．２． テンプレートID （TID）
９．２．１． TID 8001 Specimen Preparation （標本準備）
９．２．２． TID 8002 Specimen Sampling （標本サンプリング（切り出し）
９．２．３． TID 8003 Specimen Staining （標本の染色）
９．２．４． TID 8002 Specimen Localization （標本の位置決め）
９．３ コンテキストID （CID）
９．３．１． CID2 Anatomic Modifier （病理修飾語）
９．３．２． CID82 Units of Measurement （測定単位）
９．３．３． CID4206 Ophthalmic Channel Description （目のチャネル記述）
９．３．４． CID5001 Countries （国）
９．３．５． CID5002 Organization （組織）
９．３．６． CID7004 Waveform Purposes of Reference （参照の波形目的）
９．３．７． CID7005 Contributing Equipment Purposes of Reference
（参照の貢献設備目的）
９．３．８． CID7007 Signature Purpose （署名目的）
９．３．９． CID7030 Institutional Departments, Units and Services
（制度上の部門、ユニットやサービス）
９．３．１０．CID7201 Referenced Image Purposes of Reference
（参照の参照画像目的）
９．３．１１．CID7202 Source Image Purposes of Reference（参照の原画像目的）
９．３．１２．CID7203 Image Derivation （画像派生）
９．３．１３．CID7210 Related Series Purposes of Reference
（参照の関連するシリーズ目的）
９．３．１４．CID7454 Species （種）
９．３．１５．CID7480 Breed （種族）
９．３．１６．CID7481 Breed Registry （種族登録）
９．３．１７．CID7486 Mixed Breeds （混血）
９．３．１８．CID8101 Container Types （コンテナタイプ）
９．３．１９．CID8102 Container Component Types （コンテナ構成要素タイプ）
９．３．２０．CID8103 Anatomic Pathology Specimen Types （病理標本タイプ）
９．３．２１．CID8104 Breast Tissue Specimen Types （乳房組織標本タイプ）
９．３．２２．CID8109 Specimen Collection Procedure （採取法）
９．３．２３．CID8110 Specimen Sampling Procedure
（標本サンプリング（切り出し）法）
９．３．２４．CID8111 Specimen Preparation Procedure （標本準備法）
９．３．２５．CID8112 Specimen Stains （標本の染色法）
９．３．２６．CID8113 Specimen Preparation Steps （標本準備工程）
９．３．２７．CID8114 Specimen Fixatives （標本固定剤）
９．３．２８．CID8115 Specimen Embedding Media （標本の包埋媒体）
９．４． DICOM制御用語定義
９．５． 標準SOPクラス
１０．追加情報
１０．１．日本語における文字集合および人名の値表現
１０．２．値符号化
１０．２．１． PNの値表現をもつデータ要素の中の表意文字と表音文字
１０．２．２． 未知（UN）値表現
１０．３． 値複数度（VM）と区切り
１０．４． データ集合
１０．４．１． データ要素
１０．４．２． グループ長さ
１０．４．３． ビッグエンディアンとリトルエンディアンのバイト順
１０．４．４． データ集合の入れ子構造
１０．５． 固有識別子（UID）
１０．６． 私的定義固有識別子の生成
１０．６．１． JAHIS会員のための私的定義固有識別子（UID）
１０．７． ネイティブまたはカプセル化フォーマット符号化
１０．７．１． JPEG画像圧縮
１０．７．２． JPEG2000画像圧縮
１０．８． 転送構文
１０．８．１． DICOMデフォルト転送構文
１０．８．２． JPEG可逆圧縮のDICOMデフォルトに対する転送構文
１０．８．３． JPEG非可逆圧縮のDICOMデフォルトに対する転送構文
１０．８．４． JPEG2000圧縮のための転送構文
１０．９． 転送構文仕様
１０．９．１． DICOM暗黙的VRリトルエンディアン転送構文
１０．９．２． DICOMリトルエンディアン転送構文（明示的VR）
１０．９．３． DICOMビッグエンディアン転送構文（明示的VR）
１０．９．４． 符号化画素データのカプセル化のための転送構文
付録－１．標本管理ユースケース
（１） ユースケース－１ ：外科病理－手術材料
（２） ユースケース－２ ：内視鏡下生検
付録－２．DICOM画像フォーマット例
（１） 切り出し画像
（２） 顕微鏡画像
（３） スライド座標系顕微鏡画像
（４） 具体的なデータ例
付録－３．作成者名簿
２．適用範囲
３．引用規格・引用文献
４．用語定義
４．１． 主要用語
４．２． 値表現（VR）
４．２．１． AE 応用エンティティ （Application Entily）
４．２．２． AS 年齢別 （Age String）
４．２．３． AT 属性タグ （Attribute Tag）
４．２．４． CS コード列 （Code String）
４．２．５． DA 日付 （Date）
４．２．６． DS 10進数列 （Decimal String）
４．２．７． DT 日時 （Date Time）
４．２．８． FL 単精度浮動小数点 （Floating Point Single）
４．２．９． FD 倍精度浮動小数点 （Floating Point Double）
４．２．１０． ＩＳ 整数列 （Integer String）
４．２．１１． LO 長列 （Long String）
４．２．１２． LT 長テキスト （Long Text）
４．２．１３． OB その他のバイト列 （Other Byte String）
４．２．１４． ＯＦ その他の浮動列 （Other Float String）
４．２．１５． OW その他のワード列 （Other Word String）
４．２．１６． PN 人名 （Person Name）
４．２．１７． SH 短列 （Short String）
４．２．１８． ＳＬ 符号付長整数 （Signed Long）
４．２．１９． SQ 項目のシーケンス （Sequence of Items）
４．２．２０． ＳＳ 符号付き短整数 （Signed Short）
４．２．２１． ＳＴ 短テキスト （Short Text）
４．２．２２． TM 時間 （Time）
４．２．２３． UI 固有識別子（UI） （Unique Identifier）
４．２．２４． ＵＬ 符号なし長整数 （Unsigned Long）
４．２．２５． UN 未知 （Unknown）
４．２．２６． ＵＳ 符号なし短整数 （Unsigned Short）
４．２．２７． ＵＴ 無制限テキスト （Unlimited Text）
４．２．２８． 注意
４．３． データ要素タイプ
４．３．１． タイプ１ 必須データ要素
４．３．２． タイプ１Ｃ 条件付きデータ要素
４．３．３ タイプ２ 必須データ要素
４．３．４． タイプ２Ｃ 条件付きデータ要素
４．３．５． タイプ３ 任意選択データ要素
４．３．６． シーケンス内のデータ要素タイプ
４．４． シーケンス
４．５． 属性マクロ
５．説明的な情報
５．１． 標本の識別・管理
６．DICOM画像データ構造
６．１． 画像データ構造
６．２． DICOMファイルメタ情報
６．３． ＶＬ（可視光）顕微鏡画像情報オブジェクト定義
６．４． ＶＬ（可視光）スライド座標顕微鏡画像情報オブジェクト定義
６．５． ＶＬ（可視光）写真画像情報オブジェクト定義
７．情報オブジェクト定義（ＩＯＤ）モジュール
７．１． 患者モジュール （Patient Module）
７．２． 一般検査モジュール （General Study Module）
７．３． 一般シリーズモジュール （General Series Module）
７．４． 基準座標系モジュール （Frame Of Reference Module）
７．５． 一般的装置モジュール （General Equipment Module）
７．６． 一般画像モジュール （General Image Module）
７．７． 画像画素モジュール （Image Pixel Module）
７．８． 収集コンテキストモジュール （Acquisition Context Module）
７．９． 標本モジュール （Specimen Module）
７．１０．ＶＬ（可視光）画像モジュール （ＶＬ Image Module）
７．１１．スライド座標モジュール （Slide Coordinates Module）
７．１２．SOP共通モジュール （SOP Common Module）
８．属性マクロ
８．１． コードシーケンスマクロ （Code Sequence Macro）
８．２． 人識別マクロ （Person Identification Macro）
８．３． 内容項目マクロ （Content Item Macro）
８．４． 画像SOPインスタンス参照マクロ （Image SOP Instance Reference Macro）
８．５． 一般病理マクロ （General Anatomy Macros）
８．５．１． 一般病理必須マクロ （General Anatomy Mandatory Macro）
８．５．２． 一般病理要求マクロ （General Anatomy Required Macro）
８．５．３． 一般病理任意マクロ （General Anatomy Optional Macro）
８．５．４． 主要病理構造マクロ （Primary Anatomy Structure Macro）
８．６． 依頼属性マクロ （Request Attributes Macro）
８．７． SOPインスタンス参照マクロ （SOP Instance Reference Macro）
８．８． 実行検査構成要素概要マクロ （Performed Procedure Step Summary Macro）
８．９． HL7v2階層指定子マクロ （HL7ｖ2 Hierarchic Designator Macro）
８．１０．患者ID発行者マクロ （Issuer of Patient ID Macro）
９．マッピング・リソース
９．１． 略語等説明
９．２． テンプレートID （TID）
９．２．１． TID 8001 Specimen Preparation （標本準備）
９．２．２． TID 8002 Specimen Sampling （標本サンプリング（切り出し）
９．２．３． TID 8003 Specimen Staining （標本の染色）
９．２．４． TID 8002 Specimen Localization （標本の位置決め）
９．３ コンテキストID （CID）
９．３．１． CID2 Anatomic Modifier （病理修飾語）
９．３．２． CID82 Units of Measurement （測定単位）
９．３．３． CID4206 Ophthalmic Channel Description （目のチャネル記述）
９．３．４． CID5001 Countries （国）
９．３．５． CID5002 Organization （組織）
９．３．６． CID7004 Waveform Purposes of Reference （参照の波形目的）
９．３．７． CID7005 Contributing Equipment Purposes of Reference
（参照の貢献設備目的）
９．３．８． CID7007 Signature Purpose （署名目的）
９．３．９． CID7030 Institutional Departments, Units and Services
（制度上の部門、ユニットやサービス）
９．３．１０．CID7201 Referenced Image Purposes of Reference
（参照の参照画像目的）
９．３．１１．CID7202 Source Image Purposes of Reference（参照の原画像目的）
９．３．１２．CID7203 Image Derivation （画像派生）
９．３．１３．CID7210 Related Series Purposes of Reference
（参照の関連するシリーズ目的）
９．３．１４．CID7454 Species （種）
９．３．１５．CID7480 Breed （種族）
９．３．１６．CID7481 Breed Registry （種族登録）
９．３．１７．CID7486 Mixed Breeds （混血）
９．３．１８．CID8101 Container Types （コンテナタイプ）
９．３．１９．CID8102 Container Component Types （コンテナ構成要素タイプ）
９．３．２０．CID8103 Anatomic Pathology Specimen Types （病理標本タイプ）
９．３．２１．CID8104 Breast Tissue Specimen Types （乳房組織標本タイプ）
９．３．２２．CID8109 Specimen Collection Procedure （採取法）
９．３．２３．CID8110 Specimen Sampling Procedure
（標本サンプリング（切り出し）法）
９．３．２４．CID8111 Specimen Preparation Procedure （標本準備法）
９．３．２５．CID8112 Specimen Stains （標本の染色法）
９．３．２６．CID8113 Specimen Preparation Steps （標本準備工程）
９．３．２７．CID8114 Specimen Fixatives （標本固定剤）
９．３．２８．CID8115 Specimen Embedding Media （標本の包埋媒体）
９．４． DICOM制御用語定義
９．５． 標準SOPクラス
１０．追加情報
１０．１．日本語における文字集合および人名の値表現
１０．２．値符号化
１０．２．１． PNの値表現をもつデータ要素の中の表意文字と表音文字
１０．２．２． 未知（UN）値表現
１０．３． 値複数度（VM）と区切り
１０．４． データ集合
１０．４．１． データ要素
１０．４．２． グループ長さ
１０．４．３． ビッグエンディアンとリトルエンディアンのバイト順
１０．４．４． データ集合の入れ子構造
１０．５． 固有識別子（UID）
１０．６． 私的定義固有識別子の生成
１０．６．１． JAHIS会員のための私的定義固有識別子（UID）
１０．７． ネイティブまたはカプセル化フォーマット符号化
１０．７．１． JPEG画像圧縮
１０．７．２． JPEG2000画像圧縮
１０．８． 転送構文
１０．８．１． DICOMデフォルト転送構文
１０．８．２． JPEG可逆圧縮のDICOMデフォルトに対する転送構文
１０．８．３． JPEG非可逆圧縮のDICOMデフォルトに対する転送構文
１０．８．４． JPEG2000圧縮のための転送構文
１０．９． 転送構文仕様
１０．９．１． DICOM暗黙的VRリトルエンディアン転送構文
１０．９．２． DICOMリトルエンディアン転送構文（明示的VR）
１０．９．３． DICOMビッグエンディアン転送構文（明示的VR）
１０．９．４． 符号化画素データのカプセル化のための転送構文
付録－１．標本管理ユースケース
（１） ユースケース－１ ：外科病理－手術材料
（２） ユースケース－２ ：内視鏡下生検
付録－２．DICOM画像フォーマット例
（１） 切り出し画像
（２） 顕微鏡画像
（３） スライド座標系顕微鏡画像
（４） 具体的なデータ例
付録－３．作成者名簿